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新一代高通量單細(xì)胞測序系統(tǒng)
簡要描述:

新一代高通量單細(xì)胞測序系統(tǒng),10x Genomics公司推出新一代單細(xì)胞測儀器Chromium X,高通量單細(xì)胞捕獲,還可以大大降低單個細(xì)胞的捕獲成本。

  • 產(chǎn)品型號:
  • 廠商性質(zhì):經(jīng)銷商
  • 更新時間:2024-12-03
  • 訪  問  量:859

詳細(xì)介紹

一、新一代高通量單細(xì)胞測序系統(tǒng)的原理:
10x Genomics自2016年進(jìn)軍單細(xì)胞領(lǐng)域以來,最開始以經(jīng)典款儀器——Chromium Controller不斷開發(fā)新應(yīng)用,解鎖單細(xì)胞多組學(xué)。隨后,為了解放科研人員的雙手,減少人為誤差,又推出了單細(xì)胞捕獲自動化工作站—— Chromium Connect。然而,就在最近,為了滿足科研工作者對更高通量單細(xì)胞捕獲的需求,10x 推出了Chromium X,即百萬單細(xì)胞捕獲的神器,帶您探索更多可能!

新一代高通量單細(xì)胞測序系統(tǒng)


二、為什么要用百萬單細(xì)胞捕獲神器——Chromium X?

當(dāng)10x Genomics的Chromium Controller問世以來,科學(xué)家就驚嘆于它的高通量,一次上機(jī),八個通道,高通量可做到捕獲8萬個單細(xì)胞。如此高的通量和單細(xì)胞分辨率大大提速了科研工作者的研究,新的發(fā)現(xiàn),新的成果層出不窮,高分文章發(fā)發(fā)發(fā)不停!

新一代高通量單細(xì)胞測序系統(tǒng)

但是,通過對近幾年單細(xì)胞文章捕獲的細(xì)胞數(shù)量的統(tǒng)計(jì),我們也會發(fā)現(xiàn),現(xiàn)在文章中所涉及到的細(xì)胞數(shù)目也越來越多了,更多的單細(xì)胞數(shù)據(jù),有助于我們拿到更好的實(shí)驗(yàn)結(jié)果。

新一代高通量單細(xì)胞測序系統(tǒng)

三、并且,在我們面對一些特定的科學(xué)問題的時候,我們確實(shí)是需要百萬級別的單細(xì)胞才能解開一個真相,比如說:

(1)人類器官圖譜構(gòu)建。對于一個器官而言,其細(xì)胞的多樣性絕不是幾萬甚至幾十萬個細(xì)胞就能*描繪的,我們需要做到百萬級別的細(xì)胞數(shù)量,才能全面的描繪一個器官所有的細(xì)胞類型,這個時候,Chromium X無疑是我們更好的選擇!

(2)CRISPR篩選。在CRISPR單細(xì)胞篩選的過程中,一般需要將一種gRNA導(dǎo)入到80-100個細(xì)胞中,然后看其對基因的擾動。如果我們有一個1萬條gRNA的庫,那么我們就需要捕獲百萬級別的單細(xì)胞來進(jìn)行CRISPR篩選,這個時候,Chromium X將是我們研究的利器!

(3)T/B細(xì)胞克隆亞型分析。對于免疫研究的老師,大家都知道TCR/BCR的克隆亞型極其豐富,如果我們只測幾萬個細(xì)胞,是很難覆蓋所有的克隆亞型的,這個時候,Chromium X將給您帶來更大的幫助!

更重要的一點(diǎn)是,如果您使用Chromium X進(jìn)行高通量單細(xì)胞捕獲,還可以大大降低單個細(xì)胞的捕獲成本。

新一代高通量單細(xì)胞測序系統(tǒng)

四、Chromium X,捕獲原理是什么?

Chromium X的單細(xì)胞捕獲原理還是基于Next GEM的微流控捕獲原理,細(xì)胞和反應(yīng)試劑及Geal Beads被包裹在一個油滴里。每個油滴形成一個微反應(yīng)體系,同細(xì)胞里的RNA被標(biāo)記上相同的10x Barcoded。測序后,對單細(xì)胞數(shù)據(jù)進(jìn)行拆分。不過,Chromium X有16個通道,每個通道最多可以捕獲2萬個單細(xì)胞。此外,現(xiàn)在10x Genomics的儀器還支持混樣(CellPlex),一個通道最多可以混12個樣本,混樣后,一個通道最多可以拿到4.6萬個單個細(xì)胞,一次上機(jī),最多可以拿到73萬個單個細(xì)胞(該數(shù)字是去除雙細(xì)胞拿到的最終單個細(xì)胞數(shù)量)。雙細(xì)胞捕獲率為0.4%/1000個細(xì)胞。上機(jī)一次運(yùn)行的時間不超過18min。此外,X還加入了溫控裝置,確保拿到的數(shù)據(jù)質(zhì)量更高。

新一代高通量單細(xì)胞測序系統(tǒng)


五、Chromium X,可以做哪些應(yīng)用?

高通量版本的Chromium X,不僅可以實(shí)現(xiàn)之前的Chromium Controller的單細(xì)胞3端轉(zhuǎn)錄組解決方案,同時還可以進(jìn)行細(xì)胞表面蛋白的檢測,CRISPR單細(xì)胞大規(guī)模篩選,靶向捕獲,及混樣(CellPlex);還可以實(shí)現(xiàn)基于5端RNA捕獲的單細(xì)胞免疫組解決方案,檢測單細(xì)胞全長配對的VDJ序列,細(xì)胞表面蛋白檢測,抗原特異性檢測,靶向捕獲,CRISPR篩選(2022年推出),混樣(2022年推出)。此外Chromium X還可以兼容Chromium Controller 的試劑和芯片。也就是說,您可以直接將八個通道的Chromium Controller芯片用于Chromium X上,并且這個時候,我們就可以在Chromium X上實(shí)現(xiàn)Chromium Controlle的所有應(yīng)用,如單細(xì)胞ATAC,單細(xì)胞ATAC+mRNA等。

新一代高通量單細(xì)胞測序系統(tǒng)

六、新一代高通量單細(xì)胞測序系統(tǒng)物理參數(shù)展示:
新一代高通量單細(xì)胞測序系統(tǒng)
  • 重量 :18.8 kg

  • 體積:寬 x 深 x 高=28.6 厘米x 48.3 厘米x 27.3 厘

  • 電氣要求:100–240 VAC, 50/60 Hz, 250 W,90–264 V 工作范圍(額定值的 +/- 10%),過壓類別 II(標(biāo)準(zhǔn)插座)

  • 工作溫度:18–28°C

  • 濕度:30–80% R.H. 非冷凝

  • 海拔高度:0-2286 米

  • 電源線長度:2 m-包括特定國家/地區(qū)的適配器


七、Chromium X 數(shù)據(jù)展示:

10x內(nèi)部數(shù)據(jù)測試,在Chromium X上用Chromium Controller的芯片和試劑(可以叫做標(biāo)準(zhǔn)試劑芯片)進(jìn)行單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組,免疫組,ATAC及ATAC+mRNA的實(shí)驗(yàn),然后與Chromium Controller儀器上獲得的數(shù)據(jù)進(jìn)行對比,發(fā)現(xiàn)二者的相關(guān)性系數(shù)很高,說明Chromium X*兼容Chromium Controller的芯片和試劑,所以大家不必有顧慮!
新一代高通量單細(xì)胞測序系統(tǒng)


八、此外,10x還在Chromium X上做了使用高通量試劑芯片和標(biāo)準(zhǔn)試劑芯片的數(shù)據(jù)比較。實(shí)驗(yàn)中使用新鮮骨髓穿刺樣本,獲取單細(xì)胞懸液,用130個抗體進(jìn)行孵育,然后過流式篩選孵育上抗體的細(xì)胞,然后分別進(jìn)行Chromium X高通量單細(xì)胞捕獲和Chromium X標(biāo)準(zhǔn)通量捕獲,最終標(biāo)準(zhǔn)通量捕獲到8269個細(xì)胞,高通量捕獲到17581個細(xì)胞,然后進(jìn)行單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組,VDJ,細(xì)胞表面蛋白的檢測。

新一代高通量單細(xì)胞測序系統(tǒng)

九、根據(jù)檢測結(jié)果,我們發(fā)現(xiàn),高通量捕獲的細(xì)胞數(shù)量多,更能檢測出一些稀有的細(xì)胞類型,以及低豐度的TCR克隆亞型。

十、斑馬魚(北京)科技有限公司是10x Genomics公司的經(jīng)銷商,為您提供參數(shù),報(bào)價(jià),實(shí)驗(yàn)指導(dǎo),安裝培訓(xùn),售后等服務(wù)。



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