一、儀器簡介：

（1）單細胞測序儀器設備Chromium Controller，是一款小巧的單細胞建庫解碼系統(tǒng)，可放置在標準實驗工作臺上。能夠在十幾分鐘內高效地自動化生成大于10萬個含有條形碼的納升級分區(qū)，從而實現(xiàn)高度并行的樣品分液和添加分子標簽。
（2）一次處理多達8個樣品，每個樣本可分析100-10000個細胞。結合Cell Ranger數據分析軟件和Loupe Browser可視化軟件，輕松實現(xiàn)單細胞水平轉錄組、免疫分析、基因組拷貝數變異和染色質開放性等研究。品牌10x Genomics，型號GCG-SR-1，產地新加坡，代理商是斑馬魚（北京）科技有限公司。

二、為何選擇10X單細胞測序？

（1）細胞異質性是造成生物復雜性的一個關鍵因素，但往往被群體細胞分析技術——比如RNA測序（RNA-seq）或芯片分析等所掩蓋。
（2）單細胞測序技術并非提供平均數據來顯示細胞如何工作，而是讓研究人員能夠更全面地鑒定組織異質性、識別稀有細胞類型，并逐個細胞地解析分子機制。這種高分辨率能帶來突破性的成果，4000多篇采用10x Genomics公司技術的文獻便是很好的證明。

三、單細胞測序儀工作流程：

單細胞測序流程是從單細胞或細胞核懸液開始的。采用*進的微流體技術生成含有單細胞或細胞核的微滴。接著按照簡化的流程來構建文庫。測序后采用整合的數據分析流程和可視化軟件來處理和分析數據——此軟件對新用戶來說足夠直觀，對專家來說又足夠強大。

四、技術原理：

Chromium單細胞解決方案能夠從多個角度捕獲細胞活性的分子讀數，包括基因表達、染色質可接近性、細胞表面蛋白、免疫克隆型、抗原特異性以及CRISPR編輯。這項技術的核心之處在于能夠產生成千上萬個單細胞微滴，而每個微滴都含有一個可識別的條形碼，便于下游分析。

五、Next GEM技術：

①每個Chromium解決方案都從高度多樣化的凝膠珠（GelBeads）開始，每個凝膠珠都帶有的寡核苷酸條形碼標簽序列，以及便于捕獲目標分子的功能化序列。

②在Chromium系統(tǒng)內，將帶有條形碼標簽的凝膠珠與細胞或細胞核、酶以及分液油混合，產生成千上萬個單細胞乳液微滴，這些微滴被稱為“GEM"（Gel Bead-in-emulsion）。

③每個GEM都作為單獨的反應微滴，凝膠珠在其中溶解，捕獲每個細胞的目標分子，添加條形碼并擴增。

④添加條形碼后，來自同一細胞或細胞核的所有片段都共享一種10x 條形碼。將成千上萬個細胞的帶有條形碼的產物混合，進行下游反應，從而產生與短讀長測序儀兼容的文庫。

⑤在測序后，生物信息學工具將利用可識別的條形碼序列將測序片段定位到原本的單細胞或細胞核。

六、一個系統(tǒng)可實現(xiàn)多種單細胞應用：

1. 單細胞基因表達：以單細胞分辨率對數百個至數萬個細胞進行全面的3’或5’轉錄組測序，從而鑒定細胞異質性，探索發(fā)育和疾病背后的機制，并追蹤細胞譜系。

2. 單細胞免疫分析：能夠在單細胞基礎上對數萬個T細胞和B細胞的全長配對受體測序和基因表達譜分析，分析免疫細胞組庫，確定B細胞和T細胞的抗原特異性，表征組織微環(huán)境，超越傳統(tǒng)的流式細胞術。

3. 單細胞表觀基因組分析：染色質轉座酶可接近性分析（ATAC），實現(xiàn)數萬個單細胞核的表觀基因組分析，定義細胞類型和細胞狀態(tài)，收錄細胞類型特異性的調控因子，鑒定重要的轉錄因子，繪制基因調控網絡。

4. 單細胞蛋白表達：全面分析細胞類型和表型，驗證單細胞RNA-seq的結果，并闡明細胞信號通路，有助于探索分子機制或改變藥物發(fā)現(xiàn)。

5. 單細胞多組學ATAC + 基因表達解決方案：同時分析數萬個細胞的同一細胞內基因表達和開放染色質，關聯(lián)調控元件和目標基因，表征細胞異質性，發(fā)現(xiàn)新的基因調控相互作用，鑒定罕見的細胞類型。

七、技術培訓和支持：Xenium、Visium CytAssist、Chromium Connect，Chromium X、Chromium™ Next GEM Single Cell 3' GEM, Library & Gel Bead Kit、Visium Spatial for FFPE Gene Expression Kit、Chip G、Feature Barcode Library Kit……斑馬魚（北京）科技有限公司是10x Genomics代理商，負責銷售儀器和試劑，具備豐富的單細胞測序和空間轉錄組實驗方面經驗，可為用戶提供單細胞懸液制備，建庫，測序，生信分析等一整套解決方案。在購買儀器后，將安排有資質的工程師進行現(xiàn)場安裝和培訓。培訓內容包括樣本制備、儀器操作、數據分析。在培訓完成后，客戶還將獲得支持，包括遠程技術支持（Technical Support）、現(xiàn)場應用科學家（FAS）、現(xiàn)場服務工程師（FSE）和生物信息學應用（Applied Bioinformatics）團隊，覆蓋實驗工作流程、試劑耗材、儀器和軟件的各個方面。

八、儀器技術參數：

1、功能用途：通過對數千上萬個細胞的獨立分封，逆轉錄，添加標簽序列，建庫，實現(xiàn)對每個細胞的cDNA添加標簽并建庫。系統(tǒng)兼容單細胞3’表達譜測序，單細胞5’表達譜測序，單細胞VDJ全長測序，單細胞CNV測序和單細胞ATAC測序。

2、系統(tǒng)可以產生不少于50萬個獨立的液滴反應體系；

3、提供至少300萬種序列標簽標記每個細胞的轉錄組；

4、分析細胞數量：每個樣本可分析100-10000個細胞；

5、細胞捕獲效率：可達65%以上；

6、可同時檢測來自同一細胞的 mRNA 和細胞表面蛋白；

7、可靶向檢測人泛癌、免疫相關、特征性基因等，每種panel 已驗證基因數超過 1000 個；

8、針對單細胞 V(D)J 分析，可獲得單個 T 細胞 TCR 的α鏈和β鏈的配對序列信息；

9、針對單細胞 V(D)J 分析，可獲得單個B細胞 BCR的重鏈和輕鏈的配對序列信息；

10、針對單細胞 ATAC 分析，線粒體污染率低于 2%；

11、針對單細胞多組學ATAC+基因表達分析，可同時檢測來自同一細胞的mRNA和染色質可及性；

12、通量：一次可處理樣本數量不少于8個；

13、提供序列完整單細胞分析軟件系統(tǒng)；

14、儀器大小尺寸：20 x 26.3 x 16.4 cm；

15、重量：5.6公斤。

七、斑馬魚（北京）科技有限公司，是10x Genomics公司的授權經銷商，負責產品的推廣銷售和技術支持，為您提供技術參數，報價、選型、實驗指導、安裝培訓、售后服務等，更多信息可和我們聯(lián)系。